<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?>
<hibernate-mapping xmlns="urn:nhibernate-mapping-2.0">
    <class name="MySqlTest.User, MySqlTest" table="users">
        <id name="UserID" column="UserID" type="Int32" length="20">
            <generator class="identity" />
        </id>
        <property name="Name" column="name" type="String" length="40"/>
        <property name="Password" type="String" length="20"/>
        <set name="Permissions" table="UserPermissions" inverse="false" lazy="true">
            <key column="UserID"/>
            <many-to-many class="MySqlTest.Permission" column="permID"/>
        </set>
    </class>
</hibernate-mapping>

<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?>
<hibernate-mapping xmlns="urn:nhibernate-mapping-2.0">
    <class name="MySqlTest.Permission, MySqlTest" table="permissions">
        <id name="PermID" type="Int32">
            <generator class="identity" />
        </id>
        <property name="Name" column="name" type="String" length="40"/>
    </class>
</hibernate-mapping>

         Configuration cfg = new Configuration();
         cfg.AddAssembly("MySqlTest");

         ISessionFactory factory = cfg.BuildSessionFactory(); //breaks here
         ISession session = factory.OpenSession();
         Permission addPerm = (Permission)session.Load(typeof(Permission), 1);
         Permission editPerm = (Permission)session.Load(typeof(Permission), 2);

         User u = (User)session.Load(typeof(User), 1);
         u.Permissions.Add(addPerm);

         session.Save(u);
         
         session.Close();

"NHibernate.MappingException: could not find class: MySqlTest.Permission ---> System.TypeLoadException: Could not load type 'MySqlTest.Permission', check that type and assembly names are correct\r\n   at NHibernate.Util.ReflectHelper.ClassForName(String name) in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Util\\ReflectHelper.cs:line 160\r\n   at NHibernate.Cfg.HbmBinder.ClassForFullNameChecked(String fullName, String errorMessage) in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\HbmBinder.cs:line 82\r\n   --- End of inner exception stack trace ---\r\n   at NHibernate.Cfg.HbmBinder.ClassForFullNameChecked(String fullName, String errorMessage) in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\HbmBinder.cs:line 86\r\n   at NHibernate.Cfg.HbmBinder.ClassForNameChecked(String name, Mappings mappings, String errorMessage) in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\HbmBinder.cs:line 100\r\n   at NHibernate.Cfg.HbmBinder.BindManyToOne(XmlNode node, ManyToOne model, String defaultColumnName, Boolean isNullable, Mappings mappings) in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\HbmBinder.cs:line 826\r\n   at NHibernate.Cfg.HbmBinder.BindCollectionSecondPass(XmlNode node, Collection model, IDictionary persistentClasses, Mappings mappings) in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\HbmBinder.cs:line 1545\r\n   at NHibernate.Cfg.HbmBinder.BindSetSecondPass(XmlNode node, Set model, IDictionary persistentClasses, Mappings mappings) in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\HbmBinder.cs:line 2046\r\n   at NHibernate.Cfg.SetSecondPass.SecondPass(IDictionary persistentClasses) in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\HbmBinder.cs:line 1788\r\n   at NHibernate.Cfg.AbstractSecondPass.DoSecondPass(IDictionary persistentClasses) in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\HbmBinder.cs:line 1713\r\n   at NHibernate.Cfg.Configuration.SecondPassCompile() in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\Configuration.cs:line 885\r\n   at NHibernate.Cfg.Configuration.BuildSessionFactory() in c:\\net\\nhibernate\\nhibernate\\src\\NHibernate\\Cfg\\Configuration.cs:line 997\r\n   at MySqlTest.Form1.Form1_Load(Object sender, EventArgs e) in c:\\documents and settings\\skain\\my documents\\visual studio projects\\mysqltest\\form1.cs:line 120"

using System;

namespace MySqlTest
{
   /// <summary>
   /// Summary description for Permission.
   /// </summary>
   public class Permission
   {
      private int permID;
      private string name;


      public virtual int PermID
      {
         get
         {
            return permID;
         }
         set
         {
            permID = value;
         }
      }

      public virtual string Name
      {
         get
         {
            return name;
         }
         set
         {
            name = value;
         }
      }


      public Permission()
      {
         //
         // TODO: Add constructor logic here
         //
      }
   }
}

using System;
using Iesi.Collections;

namespace MySqlTest
{
   /// <summary>
   /// Summary description for User.
   /// </summary>
   public class User
   {
      private int userID;
      private string name;
      private string password;
      private ISet permissions = new HashedSet();


      public virtual ISet Permissions
      {
         get
         {
            return permissions;
         }
         set
         {
            permissions = value;
         }
      }




      public virtual int UserID
      {
         get
         {
            return userID;
         }
         set
         {
            userID = value;
         }
      }

      public virtual string Name
      {
         get
         {
            return name;
         }
         set
         {
            name = value;
         }
      }

      public virtual string Password
      {
         get
         {
            return password;
         }
         set
         {
            password = value;
         }
      }



      public User()
      {
         //
         // TODO: Add constructor logic here
         //
      }
   }
}

<many-to-many class="MySqlTest.Permission" column="permID"/>

<many-to-many class="MySqlTest.Permission, MySqlTest" column="permID"/>