for (final Livre livre : ListeLivres) {
          session.beginTransaction();
          session.merge(livre);
          session.getTransaction().commit();
        }

@Entity
public class Livre implements Serializable { 
.../...
@ManyToMany(targetEntity=com.package.Auteur.class,cascade=javax.persistence.CascadeType.ALL)
  public Set<Auteur> getAuteurs() {
    return auteurs;
  }
.../...
}

@Entity
public class Auteur implements Serializable {
   private static final long serialVersionUID = 1L;
   
   private Long id;
   
   @Id @GeneratedValue(strategy = GenerationType.AUTO)
   public Long getId () {
      return this.id;
   }
   public void setId (Long id) {
      this.id = id;
   }

  private String name;

  @Column(unique=true)
  public String getName () {
      return this.name;
  }
  public void setName (String name) {
      this.name = name;
  }
 
  public Auteur() {
  }

  public Auteur(String name) {
    this.name = name;
  }

  @Override
  public boolean equals(Object obj) {
    if (obj == null) {
      return false;
    }
    if (getClass() != obj.getClass()) {
      return false;
    }
    final Auteur other = (Auteur) obj;
    if ( (this.name == null || !this.name.equals(other.name))) {
      return false;
    }
    return true;
  }

  @Override
  public int hashCode() {
    int hash = 7;
    hash = 59 * hash + (this.name != null ? this.name.hashCode() : 0);
    return hash;
  }

  @Override
  public String toString() {
   if (this.name == null) return new String();
    return name;
  }

        session.beginTransaction();
        for (final Livre livre : ListeLivres) {
          session.merge(livre);
        }
        session.getTransaction().commit();

        session.beginTransaction();
        for (final Livre livre : ListeLivres) {

          Collection<Auteur> realAuteur = new ArrayList<Auteur>();
          for (final Auteur auteur : livre.getAuteur()) {
            Criteria crit = session.createCriteria(Livre.class);
            crit.add(Restrictions.eq("name", auteur.getName()));
            crit.setCacheable(true);

            Collection res = crit.list();         
            if(res.size() > 0) {
              //Auteur existant... on ajoute
              // pas beau ! a refaire ;)
              realAuteur.add(crit.list().iterator().next());
            } else
              // Nouvel auteur il faudra le creer
               realAuteur.add(auteur);
            }
          }
          livre.setAuteur(realAuteur);

          session.merge(livre);
        }
        session.getTransaction().commit();