public  void  updateFile(FileBean file){
          
          try {
          
          getHibernateTemplate().update(file);
          
          log.info(file.getFileID() + " updated. Status is " + file.getStatusID());
      } catch (Exception e) {
         
         log.error("Error updating file " + file.getFileID(),e);
      }
      
    }
   

<bean id="dataSource" class="com.mchange.v2.c3p0.ComboPooledDataSource" destroy-method="close">
      <property name="driverClass" value="net.sourceforge.jtds.jdbc.Driver"/>
      <property name="jdbcUrl" value="${jdbc.connectstring}"/>
      <property name="user" value="${jdbc.user}"/>
      <property name="password" value="${jdbc.password}"/>
      <property name="acquireRetryDelay" value="2000"/>
      <property name="maxPoolSize" value="200"/>
      <property name="maxIdleTime" value="60"/>
      <property name="maxStatements" value="0"/>
      <property name="maxStatementsPerConnection" value="100"/>
      <property name="testConnectionOnCheckin" value="true"/>
      <property name="acquireRetryAttempts" value="5"/>
      <property name="preferredTestQuery">
         <value>Select 'This is the connection tester DOH applicationContext.xml Connection Pool'</value>
      </property>
   </bean>

   
   <!--  HIBERNATE CONFIGURATION -->
   <bean id="sessionFactory" class="org.springframework.orm.hibernate3.LocalSessionFactoryBean">
      <property name="dataSource" ref="dataSource"/>
      
      <!-- PUT ALL HIBERNATE MAPPING FILES HERE!!! -->
      <property name="mappingResources">         
         <list>
            <value>com/argus/doh/db/RequestStatusBean.hbm.xml</value>
            <value>com/argus/doh/db/FileBean.hbm.xml</value>
            <value>com/argus/doh/db/ManagerStatusBean.hbm.xml</value>
            <value>com/argus/doh/db/ServerBean.hbm.xml</value>
            <value>com/argus/doh/db/EnvironmentBean.hbm.xml</value>
            <value>com/argus/doh/db/AppLocationBean.hbm.xml</value>
         </list>         
      </property>
      
      <property name="hibernateProperties">
         <props>
            <prop key="hibernate.dialect">org.hibernate.dialect.SQLServerDialect</prop>
            <!-- Session context management -->
                <prop key="current_session_context_class">thread</prop>

                <!-- Disable 2nd level cache -->
                <prop key="cache.provider_class">org.hibernate.cache.NoCacheProvider</prop>

                <!-- Echo all sql to stdout; useful for debugging -->
                <prop key="show_sql">true</prop>
               
                <prop key="hibernate.c3p0.max_statements">0</prop>
         </props>
      </property>
   </bean>

<bean id="fileDAO" class="com.argus.doh.db.FileDAO" singleton="false">
       <property name="sessionFactory" ref="sessionFactory"/>
    </bean>

public class Class1 {

   public void sendRequestsToServers() {
      try {
         List<ServerBean> sbs = serverDAO.getAllServersForEnvironment();

         for (ServerBean sb : sbs) {

            //this function here deadlocks all the time
            List<FileBean> fbs = fileDAO.getUnsentFilesOnServer(Status.RUNNING.value(), sb.getServerID());

            for (FileBean fb : fbs) {
               if (currentRequests.get(fb.getRequestID()) == null) {
                  thisRequest = requestDAO.getRequest(fb.getRequestID(),false);
                  currentRequests.put(fb.getRequestID(), thisRequest);
               }

               rsb = currentRequests.get(fb.getRequestID());
               OptimizationDispatcher od = (OptimizationDispatcher) AppManager.getContext().getBean("optimizationDispatcher");
               od.init(fb, sb, rsb);
               // now send the file               
               Thread t = new Thread(od);
               t.setName("OptDispatcher:FileID=" + fb.getFileID());
               t.start();
               // this ensures that the file is ONLY updated if the
               // dispatcher is successfully spawned.

               // if i keep these here, i get many more errors than if i put them inside the spawned thread
               // fb.setSentToOptimizer(true);
               // fileDAO.updateFileRaw(fb);
            }
         }
      } catch (Exception ex) {
         optLog.error("Error in sendRequestsToServers(): "+ ex.getMessage(), ex);
      }
   }

}

public void run(){
       
       fb.setSentToOptimizer(true);      
        fb.addMessage("Inside OptimizationDispatcher.run()");
        //update the fileBean that Class1 passed into this object
        fileDAO.updateFile(fb);
        RequestStatusBean updatedRequest = requestDAO.getRequest(rsb.getRequestID(),false);       
                             
        if(performOptimization){
           //other calls to fileDAO.updateFile(fb) happen inside the sendToOptimizer method
            sendToOptimizer();
        }

    }

public class FileDAO extends HibernateDaoSupport  {
 
    /**
     * returns a list of files on the given server for the given file status. These files have
     * NOT been sent to the optimizer yet
     * This query in particular seems to deadlock more frequently than other queries under heavy load,
     * which is why i have the try/catch around it
     */
    public List<FileBean> getUnsentFilesOnServer(int statusID,int serverID) {
        List<FileBean> files = new ArrayList<FileBean>();
       
        try {
            //sadly, i find that this string concat is faster than using prepared statements
           files = getHibernateTemplate().find("from FileBean  where statusID="+statusID
                   +" and serverID="+serverID
                   +" and sentToOptimizer=0");
        } catch (Exception e) {
            log.error("Error in getUnsentFilesOnServer()",e);
        }
        return files;

   
     
    public  void  updateFile(FileBean file){
      getHibernateTemplate().update(file);
      log.info(file.getFileID() + " updated. Status is " + file.getStatusID());
    }
}