private Collection findSitesByAssetCriteria(AssetCriteria assetCriteria, Boolean includeArchivedSites) throws AdvancedSearchException {
       ArrayList siteIds = new ArrayList();
       //if no criteria set, return all sites
       if(
            (!assetCriteria.getAttribute().equals(""))
         || (!assetCriteria.getAttributeOperator().equals(""))
         || (!assetCriteria.getAttributeValue().equals(""))
         || (!assetCriteria.getAssetCondition().equals(""))
         || (!assetCriteria.getAssetRef().equals(""))
         || (!assetCriteria.getAssetType().equals(""))
         || (!assetCriteria.getManufacturer().equals(""))
         || (!assetCriteria.getModel().equals(""))
         || (!assetCriteria.getActivityGroup().equals(""))
         || (!assetCriteria.getActivitySearch().equals(""))
         || (!assetCriteria.getSelectedActivity().equals(""))
         || (assetCriteria.getActivityRequiredAfter() != null)
         || (assetCriteria.getActivityRequiredBefore() != null)
       ){
          //activities stuff
          Collection siteSurveyAssetsMatchingActivities = findMatchingActivities(assetCriteria);
          if (!(siteSurveyAssetsMatchingActivities.size() > 0)) {
             return new ArrayList();
          }
          //attribute stuff
          Collection matchingAssetAttributes = findMatchingAssetAttributes(assetCriteria);
          if (!(matchingAssetAttributes.size() > 0)) {
             return new ArrayList();
          }
          //matching library assets
          List listOfLibraryAssetsMatchingCriteria = findMatchingLibraryAssets(assetCriteria);
          if (!(listOfLibraryAssetsMatchingCriteria.size() > 0)) {
             return new ArrayList();
          }
          //asset condition related stuff
          Integer assetCondId = null;
          if (!assetCriteria.getAssetCondition().equals("")) {
             assetCondId = new Integer(assetCriteria.getAssetCondition());
          }
          Collection listOfAssetsMatchingCriteria = new ArrayList();
          String assetRef = assetCriteria.getAssetRef();
          Criteria assetHibernateCriteria = getSession().createCriteria(Asset.class);
          //find matching assets based on condition and ref
          if (((listOfLibraryAssetsMatchingCriteria!= null) && (listOfLibraryAssetsMatchingCriteria.size() > 0)) || (assetCondId != null) || !assetRef.equals("")) {
             if ((listOfLibraryAssetsMatchingCriteria != null) && (listOfLibraryAssetsMatchingCriteria.size() > 0)) {
                assetHibernateCriteria.add(Expression.in("libraryAsset", listOfLibraryAssetsMatchingCriteria));
             }
             if (assetCondId != null) {
                assetHibernateCriteria.add(Expression.eq("assetCondition.id", assetCondId));
             }
             if (!assetRef.equals("")) {
                assetHibernateCriteria.add(Expression.eq("ref", assetRef));
             }
             listOfAssetsMatchingCriteria = assetHibernateCriteria.list();
             if (!(listOfAssetsMatchingCriteria.size() > 0)) {
                return  new ArrayList();
             }
          }
          List listOfAssetsMatchingAttributes = new ArrayList();
          //any assets which match based on attribute match
          if (!assetCriteria.getAttribute().equals("") && !assetCriteria.getAttributeOperator().equals("") && !assetCriteria.getAttributeValue().equals("")) {
             if (matchingAssetAttributes != null) {
                for (Iterator iter = matchingAssetAttributes.iterator(); iter.hasNext(); ) {
                   AssetAttribute current = (AssetAttribute) iter.next();
                   listOfAssetsMatchingAttributes.add(current.getAsset());
                }
             }
          }
          else {//some assets do not appear in the list even if have entire list of AssetAttributes
             listOfAssetsMatchingAttributes = getSession().createCriteria(Asset.class).list();
          }
          Collection siteLocationIds = new ArrayList();
          Collection siteLocations = new ArrayList();
          Collection allMatchingAssets = new ArrayList();
          //remove dupes by putting into set
          allMatchingAssets = new HashSet(intersectionBetweenCollections(new HashSet(listOfAssetsMatchingAttributes), new HashSet(listOfAssetsMatchingCriteria)));
          if(
                (!assetCriteria.getAttribute().equals(""))
             || (!assetCriteria.getAttributeOperator().equals(""))
             || (!assetCriteria.getAttributeValue().equals(""))
             || (!assetCriteria.getAssetCondition().equals(""))
             || (!assetCriteria.getAssetRef().equals(""))
             || (!assetCriteria.getAssetType().equals(""))
             || (!assetCriteria.getManufacturer().equals(""))
             || (!assetCriteria.getModel().equals(""))
          ){
             for (Iterator iter = allMatchingAssets.iterator(); iter.hasNext(); ) {
                Asset currentAsset = (Asset) iter.next();
                siteLocationIds.add(currentAsset.getSiteLocation().getId());
             }
          }
          else {//some site locations do not appear in list even if have entire list of assets
             siteLocations = getSession().createCriteria(SiteLocation.class).list();
             for (Iterator iter = siteLocations.iterator(); iter.hasNext(); ) {
                SiteLocation current = (SiteLocation) iter.next();
                siteLocationIds.add(current.getId());
             }
          }
          Collection siteLocationIdsSet = new HashSet(siteLocationIds);
          Criteria siteLocationCriteria = getSession().createCriteria(SiteLocation.class);
          if (siteLocationIdsSet.size() > 0) {
             siteLocationCriteria.add(Expression.in("id", siteLocationIdsSet));
          }
       ///////////////////   
          Collection siteLocationIdsMatchingActivities = new ArrayList();
          if(
                (!assetCriteria.getActivityGroup().equals(""))
             || (!assetCriteria.getActivitySearch().equals(""))
             || (!assetCriteria.getSelectedActivity().equals(""))
             || (assetCriteria.getActivityRequiredAfter() != null)
             || (assetCriteria.getActivityRequiredBefore() != null)
          ){
             for (Iterator iter = siteSurveyAssetsMatchingActivities.iterator(); iter.hasNext(); ) {
                SiteSurveyAsset current = (SiteSurveyAsset) iter.next();
                siteLocationIdsMatchingActivities.add(current.getSiteLocation().getId());

             }
             //only restrict based on activities if there are any activity criteria
             Collection siteLocationIdsMatchingActivitiesSet = new HashSet(siteLocationIdsMatchingActivities);
             if ((siteSurveyAssetsMatchingActivities != null) && (siteSurveyAssetsMatchingActivities.size() > 0)) {
                siteLocationCriteria.add(Expression.in("id", siteLocationIdsMatchingActivitiesSet));
             }
          }
          //else {//some site locations do not appear in list even if have entire list of assets
          //   siteLocations = getSession().createCriteria(SiteLocation.class).list();
          //   for (Iterator iter = siteLocations.iterator(); iter.hasNext(); ) {
          //      SiteLocation current = (SiteLocation) iter.next();
          //      siteLocationIdsMatchingActivities.add(current.getId());
          //   }
          //}
          ////////////////////////
         List listOfMatchingSiteLocations = siteLocationCriteria.list();
         for (Iterator iter = listOfMatchingSiteLocations.iterator(); iter.hasNext(); ) {
            SiteLocation currentLocation = (SiteLocation) iter.next();
            siteIds.add(currentLocation.getSite().getSiteId());
         }
       }
       else {
         Collection listOfAllSites = getSession().createCriteria(Site.class).list();
         for (Iterator iter = listOfAllSites.iterator(); iter.hasNext(); ) {
            Site current = (Site) iter.next();
            siteIds.add(current.getSiteId());
         }
       }
       //match based on survey/surveyor
       Integer surveyId = null;
       if (!assetCriteria.getSurvey().equals("")) {
          surveyId = new Integer(assetCriteria.getSurvey());
       }
       Integer surveyorId = null;
       if (!assetCriteria.getSurveyor().equals("")) {
          surveyorId = new Integer(assetCriteria.getSurveyor());
       }
       ArrayList allSiteIds = new ArrayList();
       // Collection allSites = new ArrayList(); // The local variable allSites is never read???
       if ((surveyorId != null) || (surveyId != null)) {
          Collection matchingSiteIdsBasedOnSurveyCriteria = new ArrayList();
          matchingSiteIdsBasedOnSurveyCriteria = findMatchingSiteSurveys(surveyId, surveyorId);
          allSiteIds = intersectionBetweenCollections(siteIds, matchingSiteIdsBasedOnSurveyCriteria);
       }
       else {
          allSiteIds = siteIds;
       }
       Criteria siteCriteria = getSession().createCriteria(Site.class);
        if (!includeArchivedSites) {
           siteCriteria.add(Expression.eq("siteDeleted", Boolean.FALSE));
        }
       if ((allSiteIds != null) && (allSiteIds.size() > 0)) {
          Collection allMatches = new ArrayList();
          List currentList = new ArrayList();
          Collection currentSites = new ArrayList();
          //if all SiteIds > 2000, need to do search in batches or get hibernate error
          if (allSiteIds.size() > 2000) {
             int fromIndex = 0;
             int toIndex = 1000;
             for (int i = 0; i < allSiteIds.size(); i = i + 1000) {
                currentList = allSiteIds.subList(fromIndex, toIndex);
                   Criteria siteCriteriaSublist = getSession().createCriteria(Site.class);
                  if (!includeArchivedSites) {
                     siteCriteriaSublist.add(Expression.eq("siteDeleted", Boolean.FALSE));
                  }
                  siteCriteriaSublist.add(Expression.in("siteId", currentList));
                  currentSites = siteCriteriaSublist.list();
                allMatches.addAll(currentSites);
                fromIndex = toIndex;
                toIndex = toIndex + 1000;
                if (toIndex > allSiteIds.size()) {
                   toIndex = allSiteIds.size();
                }
                if (fromIndex == toIndex) {
                   break;
                }
             }
             return allMatches;
          }
          return siteCriteria.add(Expression.in("siteId", allSiteIds)).list();
       }
       return new ArrayList();
    }