@Entity
@Table(name = "identificacion", schema = "etr")
public class Identificacion implements java.io.Serializable {

   private int codigoEtr;
   ....... more properties .......

   private Set<IdentificacionEntidades> identificacionEntidadeses = new HashSet<IdentificacionEntidades>(0);
   

   public Identificacion() {
   }


   @Id @GeneratedValue(strategy=GenerationType.SEQUENCE)
   @Column(name = "codigo_etr", unique = true, nullable = false)
   public int getCodigoEtr() {
      return this.codigoEtr;
   }

   public void setCodigoEtr(int codigoEtr) {
      this.codigoEtr = codigoEtr;
   }


   @OneToMany(fetch = FetchType.LAZY, mappedBy = "identificacion",cascade=CascadeType.ALL)
   public Set<IdentificacionEntidades> getIdentificacionEntidadeses() {
      return this.identificacionEntidadeses;
   }

   public void setIdentificacionEntidadeses(
         Set<IdentificacionEntidades> identificacionEntidadeses) {
      this.identificacionEntidadeses = identificacionEntidadeses;
   }

@Entity
@Table(name = "identificacion_entidades", schema = "etr")
public class IdentificacionEntidades implements java.io.Serializable {    // this is the relation table between identificacion and entidad

   private IdentificacionEntidadesId id;   // composite key that contains two identifiers of relationated  classes
   private Entidad entidad;
   private Identificacion identificacion;
   private String codigo;

   public IdentificacionEntidades() {
   }

   public IdentificacionEntidades(IdentificacionEntidadesId id,
         Entidad entidad, Identificacion identificacion, String codigo) {
      this.id = id;
      this.entidad = entidad;
      this.identificacion = identificacion;
      this.codigo = codigo;
   }


   
   @EmbeddedId
   @AttributeOverrides( {
         @AttributeOverride(name = "codigoEtr", column = @Column(name = "codigo_etr",insertable=true,updatable=true, nullable = false)),
         @AttributeOverride(name = "idEntidad", column = @Column(name = "id_entidad",insertable=true,updatable=true, nullable = false)) })
   @NotNull
   public IdentificacionEntidadesId getId() {
      return this.id;
   }

   public void setId(IdentificacionEntidadesId id) {
      this.id = id;
   }

   @ManyToOne(fetch = FetchType.LAZY)
   @JoinColumn(name = "id_entidad", nullable = false, insertable = false, updatable = false)
   @NotNull
   
   public Entidad getEntidad() {
      return this.entidad;
   }

   public void setEntidad(Entidad entidad) {
      this.entidad = entidad;
   }

   @ManyToOne(fetch = FetchType.LAZY)
   @JoinColumn(name = "codigo_etr", nullable = false, insertable = false, updatable = false)
   @NotNull
   public Identificacion getIdentificacion() {
      return this.identificacion;
   }

   public void setIdentificacion(Identificacion identificacion) {
      this.identificacion = identificacion;
   }

   @Column(name = "codigo", nullable = false, length = 200)
   @NotNull
   @Length(max = 200)
   public String getCodigo() {
      return this.codigo;
   }

   public void setCodigo(String codigo) {
      this.codigo = codigo;
   }

}

@Embeddable
public class IdentificacionEntidadesId implements java.io.Serializable {

   private int codigoEtr;
   private int idEntidad;

   public IdentificacionEntidadesId() {
   }

   public IdentificacionEntidadesId(int codigoEtr, int idEntidad) {
      this.codigoEtr = codigoEtr;
      this.idEntidad = idEntidad;
   }

   @Column(name = "codigo_etr")
   public int getCodigoEtr() {
      return this.codigoEtr;
   }

   public void setCodigoEtr(int codigoEtr) {
      this.codigoEtr = codigoEtr;
   }

   @Column(name = "id_entidad")
   public int getIdEntidad() {
      return this.idEntidad;
   }

   public void setIdEntidad(int idEntidad) {
      this.idEntidad = idEntidad;
   }

identificacionEntidadesHome.getInstance().setEntidad(entidad);
identificacionEntidadesHome.getInstance().setIdentificacion(identificacionHome.getInstance());
identificacionHome.getInstance().getIdentificacionEntidadeses().add(identificacionEntidadesHome.getInstance());
identificacionHome.persist();

insert
    into
        etr.identificacion
        (id_autoridad, id_bien, caracteristicas_tecnicas, id_clasificacion_generica, id_comarca, componentes, cuadro, id_elm, espacio, id_municipio, pre_tipo, id_provincia, sector, sintesis_historica, id_tipo_objeto, ubicacion_inmueble, ue, id_yacimiento, codigo_etr)
    values
        (?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)      // Insert the first element good
13:30:40,651 INFO  [STDOUT] Hibernate:
    insert
    into
        etr.identificacion_entidades
        (codigo, codigo_etr, id_entidad)
    values
        (?, ?, ?)                             // but when have to insert second, don't have the keys
13:30:40,730 WARN  [JDBCExceptionReporter] SQL Error: 0, SQLState: 23503
13:30:40,730 ERROR [JDBCExceptionReporter] Batch entry 0 insert into etr.identificacion_entidades (codigo, codigo_etr, id_entidad) values ('somethink', '0', '0') was aborted.  Call getNextException to see the cause.
13:30:40,730 WARN  [JDBCExceptionReporter] SQL Error: 0, SQLState: 23503
13:30:40,730 ERROR [JDBCExceptionReporter] ERROR: inserción o actualización en la tabla «identificacion_entidades» viola la llave foránea «fk_etr_identificacion_entidades_id_entidad»
  Detail: La llave (id_entidad)=(0) no está presente en la tabla «entidad».